Ein Isolat findet sich häufig bei Molkenprotein, auch Whey-Protein genannt. Das Isolat zeichnet sich durch eine besonders hohe Reinheit aus. Die hohe Reinheit wird durch das Mikrofiltrationsverfahren ohne Salze erzielt. Der Eiweißanteil im Isolat ist häufig bis zu 96%. Auch enthält das Isolat in der Regel weniger als 1% Fett und Laktose.
Vor allem Fitnesssportler, die wert auf eine maximale Hochwertigkeit ihrer Eiweiß-Supplementierung legen, greifen zum teureren Isolat-Protein. Auch ist es bei Personen mit Laktoseintoleranz sehr beliebt sowie bei Wettkampfsportlern in der Wettkampfvorbereitung.